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RPC- Rétrovirus Intégration Virale & Vaccins (RI2V)

Presentation

Nos travaux concernent l’étude des virus, notamment les rétrovirus, et le développement de stratégies de lutte contre ces virus. Les rétrovirus sont des virus à ARN, enveloppés, pathogènes, trouvés dans de nombreuses espèces animales et chez l’homme. Nos modèles sont représentés en particulier par les rétrovirus aviaires (famille des ASLV (Avian Sarcoma and Leukemia Viruses), porcins (Porcine Endogenous Retroviruses (PERV)) et humains (Virus de l’Immunodéficience humaine (VIH-1)).

Nous développons des projets de recherche fondamentale et des projets à visées d’application :

- Dans le cadre d’études fondamentales, nous cherchons à décrire et mieux comprendre : (i) les constituants du virus et les mécanismes viraux de réplication, en particulier ceux impliqués dans l’intégration (insertion du génome rétroviral dans celui-de la cellule hôte) et l’assemblage du virus ; (ii) les interactions mises en jeu entre le virus et la cellule infectée, en particulier les réponses de la cellule (ARNm, protéines) induites par l’infection virale ; (iii) l’utilisation de microvésicules comme transporteurs d’informations génétiques et de protéines thérapeutiques, projet qui est à la charnière du fondamental (paramètres de l’incorporation de macromolécules dans les microvésicules) et de l’appliqué (macromolécules à activité thérapeutique ou bio-médicaments).

 - D’un point de vue appliqué, nos travaux ont pour objectifs : (i) le développement d’inhibiteurs antiviraux (molécules de synthèse, peptides, ankyrines présentant des motifs répéts) dirigés contre les étapes d’intégration et d’assemblage du virus et (ii) le développement de nouveaux vecteurs vaccinaux basé sur l’utilisation de pseudo-particules virales (VLPs) pour présenter des antigènes (ex : des épitopes de l’enveloppe de certains Flavivirus, comme le Virus de la Dengue et du Virus du Nil Occidental).

Ces travaux reposent sur une approche multidisciplinaire (virologie, biologie moléculaire et biologie cellulaire, biochimie, bioinformatique et analyses structurales) et un réseau de collaborations (P. Gouet, Laboratoire de Biocristallographie (IBCP de Lyon), Yannick Blanchard (Unité de Génétique Virale (ANSES de Ploufragan), Philippe Maurin (Laboratoire de Chimie, ENS de Lyon). Mah-Lee Ng (National University of Singapore, Faculty of Medicine).

 

 

Contact

 

  1. Responsable d'équipe : Corinne RONFORT
  2. Adresse :UMR 754 INRA-ENVL-UCBL-EPHE
    1. 50, Avenue Tony Garnier
    2. 69366 Lyon Cedex 07
    3. Téléphone : +33 437 287 629
    4. Fax : +33 437 287 605
  3. E-mail : corinne.ronfort@univ-lyon1.fr

 

 

Publications recentes

 

1- Publications (depuis 2010)
- 2015-

Trabaud MA, Cotte L, Saison J, Ramière C, Ronfort C, Venet F, Tardy JC, Monneret G, André P. 2015. Persistent production of an integrase-deleted HIV-1 variant with no resistance mutation and wild-type proviral DNA in a treated patient. AIDS Res Hum Retroviruses 31(1):142-9.

- 2014 -

Crystal structure of an antiviral ankyrin targeting the HIV-1 capsid and molecular modeling of the ankyrin-capsid complex. 2014. Praditwongwan W, Chuankhayan P, Saoin S, Wisitponchai T, Lee VS, Nangola S, Hong SS, Minard P, Boulanger P, Chen CJ, Tayapiwatana C. J Comput Aided Mol Des. 28(8):869-84.

Losa D, Köhler T, Bellec J, Dudez T, Crespin S, Bacchetta M, Boulanger P, Hong SS, Morel S, Nguyen TH, van Delden C, Chanson M. 2014. Pseudomonas aeruginosa-induced apoptosis in airway epithelial cells is mediated by gap junctional communication in a JNK-dependent manner. J Immunol. 15;192(10):4804-12.

Sumarheni S, Hong SS, Josserand V, Coll JL, Boulanger P, Schoehn G, Fender P. 2014. Human full-length coagulation factor X and a GLA domain-derived 40-mer polypeptide bind to different regions of the adenovirus serotype 5 hexon capsomer. Hum Gene Ther. 25(4):339-49.

- 2013 -

Cellier C, Moreau K, Gallay K, Ballandras A, Gouet P, Ronfort C. 2013. In vitro functional analyses of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase mutants give new insights into the intasome assembly. Virology: 439(2):97-104.

Chua AJ, Vituret C, Tan ML, Gonzalez G, Boulanger P, Ng ML, Hong SS. 2013. A novel platform for virus-like particle-display of flaviviral envelope domain III: induction of Dengue and West Nile virus neutralizing antibodies. Virol J. 24;10:129.
- 2012 -

Gay V, Moreau K, Hong SS. & Ronfort C. 2012. Quantification of HIV-based lentiviral vectors: influence of several cell type parameters on vector infectivity. Arch Virol. 157(2):217-23.

Nangola, S., Urvoas, A., Valerio-Lepiniec, M., Khamaikawin, W., Sakkhachornphop, S., Hong, S.S., Boulanger, P., Philippe Minard, P. & Tayapiwatana, C. 2012. Antiviral activity of recombinant ankyrin targeted to the capsid domain of HIV-1 Gag polyprotein. Retrovirology 9:17

- 2011 -

Ballandras A, Moreau K, Robert X, Confort MP, Merceron R, Haser R, Ronfort C. & Gouet P. 2011. A crystal structure of the catalytic core domain of an avian sarcoma and leukemia virus integrase suggests an alternate dimeric assembly. PLoS One. 6(8):e23032. Brevet associé.

Charmetant J, Moreau K, Gallay K., Ballandras A, Gouet P. & Ronfort C. 2011. Functional analyses of mutants of the central core domain of an Avian Sarcoma/Leukemia Virus integrase. Virology 421(1):42-50.

Corjon, S., Gonzalez, G., Henning, P., Grichine, A., Lindholm, L., Boulanger, P., Fender, P. & Hong, S.S. 2011. Cell entry and trafficking of human adenovirus bound to blood factor X is determined by the fiber serotype and not hexon:heparan sulfate interaction. PLoS ONE, 6(5): e18205.

Gonzalez, G., DaFonseca, S., Errazuriz, E., Coric, Souquet, F., Turcaud, S., Boulanger, P., Bouaziz, S. & Hong, S.S. 2011. Characterization of a novel type of HIV-1 particle assembly inhibitor using a quantitative luciferase-Vpr packaging-based assay. PLoS ONE, 6:e27234. Brevet associé.

Grellier , E., Lécolle, K., Rogée, S., Couturier, C., Fender, P. Hong, S.S., Boulanger, P., D’Halluin, J.-C., Quesnel, B. & Colin, M. 2011. Immunoevasion molecules of the B7 family mediates the transduction of dormant tumor cells by a chimeric adenoviral vector. Molecular Cancer, 10:105

- 2010 -

Granio, O., Ashbourne Excoffon, K.J.D., Henning, P., Melin, P., Gonzalez, G., Karp, P.H., Habib, N., Lindholm, L., Becq, F., Boulanger, P., Zabner, J., & Hong, S.S. 2010. Adenovirus 5-fiber 35 chimeric vector mediates efficient apical correction of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator defect in cystic fibrosis primary airway epithelia. Human Gene Therapy, 21, 1-19.

Kitidee, K., Nangola, S., Gonzalez, G., Boulanger, P. Tayapiwatana, C. & Hong, S.S. 2010. Baculovirus display of single chain antibody (scFv) using a novel signal peptide. BMC Biotechnology, 10:80.

2. Livres & Ouvrages d’enseignement

Gonzalez, G. & Boulanger, P. & Hong, S.S. 2012. CFTR Gene Transfer and Tracking the CFTR Protein in the Airway Epithelium. In Cystic Fibrosis: Renewed Hopes Through Research. Dinesh Sriramulu, Editor. InTech - Open Access Publisher. Website: http://www.intechopen.com/

Darlix, J.-L. & Boulanger, P. 2011. Overview of the replication of the Human immunodeficiency virus type 1, its variability, and the pivotal role of the nucleocapsid. In Viruses Responsible for Emerging Diseases in South-East Asia, pp 63-130. Nguyen Tran Hien (NIHE, Hanoi, Vietnam), Giuseppe Baldacci, Anne-Lise Haenni, and Ennio Lucio Benedetti (Jacques Monod Institute, Paris, France), Editors, and the Université of Paris Diderot Press (Paris VII), Paris, France. Available on-line at : imp7@univ-paris-diderot.fr.

3. Brevets (2010-2015)

Patent N° 13 59751 HCL-UCBL-UCSD-INSERM-VetAgroSup, deposited Oct 8, 2013 : Vecteur d’expression de la protéine PUMA et son utilisation en thérapie génique. Inventors : Pierre Miossec, Saw-See Hong, Gary Firestein

International Patent No. PCT/SG2011/000109, filed on March 19th, 2011. A*STAR Exploit Technologies (National University of Singapore)-CNRS-University Lyon 1. Title : ‘A novel platform for VLP-display of vaccine antigens’. Inventors : Saw See Hong, Mah Lee Ng & Pierre Boulanger.

Patent CNRS EPC 11306138-1211 deposited 12 September 2011 : Derivatives of 3-O-(3’,3’-dimethylsuccinyl)-betulinic acid. Inventors : S. Bouaziz, Coric P., P. Boulanger, S.S. Hong, Turcaud S. Ext. to the USA 12 Sept 2012.

Patent 10290516.3 / EP10290516. Sept 30th, 2010. Novel dimeric association of the core domain of a retrovirus integrase and crystal structure thereof. CNRS-University lyon1-INRA. Ballandras A., Gouet P., Robert X., Ronfort C., Moreau K., Haser R.

Mise à jour le 20 mars 2015