Protein sciences - Old
Présentation
Protein Science Facility (PSF) permet d’accéder à une large gamme de services et d’expertises liés à l’ingénierie des protéines. La diversité des équipements et des méthodologies proposés permet aux équipes non spécialisées de développer de nouvelles stratégies expérimentales pour les études fonctionnelles de leurs protéines d’intérêt. Le plateau est certifié ISO 9001 :2015.
PSF s’est associée à l’équipe ANABIO-MS (ANAlysis of BIOmolecules by Mass Spectrometry) localisée au sein de l’ISA (Institut des Sciences Analytiques). Les deux groupes sont complémentaires en terme d’expertises en spectrométrie de masse. Cette association renforce le développement de la spectrométrie de masse sur Lyon et élargit la gamme des services proposés par PSF au plus haut niveau de la technologie.
Citation de la SFR Biosciences sur les publications
Activités
Protein Science Facility (PSF) est divisée en 3 pôles dédiés à :
- La production et la purification de protéines recombinantes (> mg) :
- La caractérisation d'échantillons par spectrométrie de masse et les études d'interactions protéine-protéine :
- La caractérisation structurale des protéines purifiées : caractérisation biophysique 2D (CD, SEC-MALS, DLS) et 3D (cristallographie aux rayons X) :
En savoir plus :
- La production et la purification de protéines recombinantes (> mg) :
Equipé de 3 systèmes automatisés de purification (AKTAs PURE), et de plusieurs équipements biophysiques de caractérisation de protéines (DLS, SEC-MALS, TSA, CD, Typhoon, Nanodrop), notre pôle propose des préparations de protéines pures et homogènes exprimées à partir du plasmide recombinant. L’équipement Liberty One CEM permet aussi d’offrir un service de synthèse peptidique.Enfin, nous disposons de puis janvier 2021 du système de western blot automatisé JESS.
- La caractérisation d’échantillons par spectrométrie de masse :
Le service de Spectrométrie de Masse, équipé de 3 spectromètres de masse, développe des protocoles analytiques centrés sur l’identification, la caractérisation des modifications post-traductionnelles, la quantification relative des protéines et la mesure de masse moléculaire. Nous prenons en charge des échantillons compris dans une gamme large de concentrations et issus de préparations très diverses.
- La caractérisation structurale des protéines purifiées : caractérisation biophysique et interactions (dichroïsme circulaire, SEC-MALS, DLS, Typhoon, BLITZ, TSA, NanoDSF) et 3D (cristallographie aux rayons X, cryomicroscopie) :
PSF propose des analyses de protéines par diffusion de la lumière (DLS, SEC-MALS), par dénaturation thermique (TSA, NanoDSF, CD), et aussi des études d’interaction moléculaires par interférométrie (BLITZ, CD).
Par ailleurs, PSF met à disposition des équipements robotiques pour les cristallographes ou propose des collaborations sur des projets d’étude structurale. PSF peut en effet prendre en charge des projets depuis le plasmide recombinant jusqu’aux tests des cristaux. Le traitement des données et l’analyse de la structure se font ensuite en collaboration avec un cristallographe associé au projet.
Enfin, dans le cadre du contrôle qualité des échantillons produits ou en amont d’expériences de cryo-microscopie électronique (cryoEM), PSF peut prendre en charge l'observation d'échantillons par TEM en coloration négative, en collaboration avec le Centre Technologique des Microstructures de l’Université de Lyon (CTµ - http://microscopies.univ-lyon1.fr/).
Contact/Localisation
La plateforme PSF est située à l’IBCP (Institut de Biologie et Chimie des Protéines). Comment accéder aux plateaux - entrée de sites (en intranet)
- 7, passage du Vercors PSF fait partie du portail MEANS
- 69367 Lyon cedex 07
Pour tout renseignement contacter : protein.science@ibcp.fr
- Responsable plateau : Virginie Gueguen-Chaignon : 04 72 72 26 69
- Frédéric Delolme (Protéomique) : 04 72 72 26 93
- Adeline Page (Protéomique) : 04 72 72 26 93
- Eric Diesis (Synthèse peptidique, biochimie préparative, études structurales) : 04 37 65 29 41
- Aurélie Thibaut (Biochimie préparative, études biophysiques) : 04 37 65 29 21
- Roland Montserret (Dichroïsme circulaire) : 04 72 72 26 48
