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LYMIC - PLATIM - Plateau d'imagerie / microscopie

https://www.sfr-biosciences.fr/plateformes/Phenotypage-cellulaire/PLATIM/PLATIM/leadImage

 

Présentation

Le Plateau Technique Imagerie/Microcopie (PLATIM) propose, à la communauté scientifique, une large offre en matière de microscopie photonique : depuis la microscopie conventionnelle avec des postes de vidéo-microscopie entièrement automatisés en passant par la microscopie confocale et bi-photonique, jusqu’à la microscopie super résolution (approches types SIM et STORM). Depuis 2018 le PLATIM dispose également d’un plateau de biophysique comprenant 2 microscopes à force atomique (AFM) et un Triboindenteur, pour réaliser des mesures de topographies 3D à haute résolution et/ou pour mesurer les propriétés mécaniques (ex module de Young) sur cellule unique ou tissus vivants.  Le plateau héberge aussi un microscope électronique à balayage (MEB) de paillasse équipé d’un bloc froid. Le PLATIM fait partie de la plateforme régionale LYMIC qui a obtenu le label IBiSA .

Citation de la SFR Biosciences sur les publications

 

Activités

Les utilisateurs de la plate-forme sont accompagnés tout au long de la chaîne d'acquisition de leurs images. L’utilisation autonome des équipements est conditionnée par une formation théorique et pratique dispensé par le personnel du PLATIM.
En amont, les utilisateurs peuvent être conseillés pour le choix de l’équipement le plus pertinent en fonction de leurs besoins ainsi qu’à la préparation de leurs échantillons.
En aval, les utilisateurs sont conseillés et encadrés, à leur demande, pour l'analyse des images obtenues. Les membres de la plate-forme sont en mesure de créer des programmes de traitement à façon, selon un cahier des charges établi à l'avance avec l'utilisateur.
En plus de cette activité de service, l'équipe du PLATIM organise une veille technologique active dans l'optique de fournir à l’ensemble de la communauté un service optimal et s'engage dans la formation initiale et continue, en participant à la mission de diffusion des savoirs.

Nos missions :

  • Soutenir l'activité de recherche des utilisateurs.
  • Mettre à disposition des systèmes d'imagerie.
  • Assurer la formation et l'assistance des utilisateurs.
  • Participer à l'enseignement supérieur et à l'animation scientifique.
  • Assurer une veille technologique.

 

Equipements

 

[Site de réservation des équipements]

Microscopie Force Atomique

  • Bioscope II Catalyst (Bruker).
  • Nanowizard III (JPK).
  • Nano-indenteur TI 950 d’Hysitron (maintenant Bruker)

Microscopie super-résolution :

  • Microscope inversé Elyra7 avec modalités SIM, SMLM (PALM/STORM…), TIRF.

Microscopie confocale:

  • Microscope Confocal inversé AxioObserverZ1 LSM800 (Zeiss).
  • Microscope Confocal inversé AxioObserverZ1 LSM800 avec module Airy Scan (Zeiss).
  • Microscope Confocal inversé AxioObserverZ1 LSM980 avec module Airy Scan 2, Multiplexe SR- Y4 (Zeiss).
  • Microscope Confocal droit spectral SP5 (Leica).
  • Microscope Confocal droit spectral SP8 à scanner résonnant (Leica).
  • Microscope Confocal inversé spectral LSM 710 (Zeiss), équipé bi-photon (Coherent).
  • 2 Microscopes Confocaux  droitsLSM 700 (Zeiss) pour gros échantillons.
  • Microscope Confocal spinning disk inversé (Leica, Yokogawa) avec module FRAP/Photo-activation.

Analyses haut débit en confocal (High Content Screening)

  • Microscope confocal spinning disk inversé (Yokogawa), logiciel d’analyse d’images intégré.

Microscopie conventionnelle :

  • Microscope droit AxioImagerZ1 (Zeiss), équipé de 2 caméras (Couleur et Noir et Blanc).
  • Microscope inversé Timelapse Axio Observer Z1 (Zeiss), équipé de 2 caméras Noir et Blanc (sCMOS et EMCCD), régulation température et CO2.
  • Microscope inversé Axiovert 135 (Zeiss), équipé d'une caméra Noir et Blanc.
  • Microscope droit Axiophot (Zeiss), équipé d'une caméra Noir et Blanc (Lyon Sud).
  • Microscope droit AxioImager Z1 (Zeiss), équipé d'une caméra Noir et Blanc (Lyon Sud).

Macroscopie :

  • Stéréomicroscope LUMAR (Zeiss) à épifluorescence équipé de 2 camérés (Couleur et Noir et Blanc).
  • Macroscope Leica Macrofluo Z16 APA A (Leica) à épifluorescence équipé d’une caméra Noir et Blanc.

Microscopie électronique :

  • Microscope électronique à balayage benchtop SH-3000 (Hirox).

Stations d’analyse :

  • Trois stations de travail pour le traitement des images.

En cours d'achat / réalisation :

  • Montage feuillet de lumière « facility-made », sur le modèle de l'openSPIM.
  • Réalisation d’une sonde de pression pour mesurer la pression de turgescence de cellule végétales (projet IMPRESS et projet Turgomap).

 

 

Contact/Localisation

Comment accéder aux plateaux - entrée de sites (en intranet)

Le Plateau Technique d'Imagerie/Microcopie est situé à l’École Normale Supérieure de Lyon et sur la faculté de médecine Lyon Sud. Après une formation, les équipements sont accessibles et réservables en ligne suite à la création d’un compte utilisateur individuel et d'une formation.

Pour tout renseignement contactez-nous :

  1. Mail : platim-ifr@ens-lyon.fr
  2. Tel : 04 72 72 87 62
  3. Responsable Plateau : Jacques Brocard

 

Formation

Les formations dédiées aux appareils sont obligatoires. Ces formations sont gratuites pour les laboratoires académiques. L'équipe s'engage dans l'enseignement (cours et TP de M2), la formation continue (6 stages de microscopie CNRS, INSERM, INRA, …) et la diffusion des savoirs (fête de la science, accueil de classes et d’élèves de collège français ou étrangers…).

Tarifs

Tarifs accessibles en intranet (équipes contributrices et équipes académiques) ou sur demande spécifique.

Documentation

Liens

Microscopie:

Nos logiciels :

  • Metamorph (Molecular Devices)
  • Zeiss
  • Huygens
  • Imaris
  • ImageJ
  • Data Processing (JPK)
  • Nanoscope Analysis (Bruker)