AniRA - Cytométrie

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Présentation

Le plateau technique AniRA-Cytométrie fournit des instruments à la pointe des dernières innovations (i.e. CyTOF 2 avec plus de 30 paramètres analysés simultanément), ainsi que l’expertise nécessaire à leur utilisation. Le plateau peut participer au développement de projets collaboratifs en matière de tri cellulaire et d’analyse par cytométrie. Ce plateau est intégré dans la plateforme régionale AniRA labélisée IBiSA, membre de l’Infrastructure de Recherche nationale Celphedia. Le plateau est certifié ISO 9001 :2008. Il abrite également une partie de l’équipex Phenocan.

Citation de la SFR Biosciences sur les publications

Activités

Dans le cadre de ses missions, la plateforme de Cytométrie en flux de la SFR Biosciences réalise un certain nombre de services :

  • Tri cellulaire :

Le plateau technique dispose d’une expertise dans le tri cellulaire et réalise les différents tris cellulaires demandés par les membres de la communauté scientifique. La disponibilité de deux trieurs digitaux, dont un à haute vitesse, permet d’optimiser les tris en fonction des besoins des utilisateurs. Il nous est également possible de trier en confinement A2.

  • Mise en place technique et acquisition :

Le plateau contribue à la mise en place des techniques de cytométrie et à leur mise à disposition de la communauté des utilisateurs. L’expertise dans la standardisation et la calibration des expérimentations de cytométrie permettent à la plateforme de participer au développement de panels multi couleurs et au déploiement d’un suivi immunologique standardisé.

  • Analyses des données :

Le plateau technique dispose d’unités informatiques dédiées à l’analyse des données et dispense une assistance à l’analyse. La plateforme dispose des derniers logiciels développés pour l’analyse des données de cytométrie tels que:

  1. Infinicyt 1.5 (Cytognos)
  2. VenturiOne (Applied Cytometry)
  3. FACS DIVA (BD Biosciences)
  4. FlowJo (Treestar)
  • Formations :

Les personnels de la plateforme réalisent, à la demande, des formations sur les différents équipements (analogiques ou digitaux) ainsi que sur les logiciels d’analyse. Ces formations durent une journée et demie et se font sur réservation. (cf. détail section « Formation »).

  • Réalisation de projets :

La cytométrie couvre aujourd’hui un grand nombre de domaine d’applications. Le plateau technique a développé une expertise dans de nombreux domaines différents de recherche.

Actuellement, la plateforme de Cytométrie en lien avec la plateforme de phénotypage AniRA-ImmOs propose des services de caractérisation phénotypique du système immunitaire par cytométrie en flux.

 

Equipements

La plateforme dispose de nombreux équipements :

 

Contact/Localisation

Comment accéder aux plateaux - entrée de sites (en intranet)

Plateau technique de Cytométrie :

  1. Tour Cervi
  2. 21 avenue Tony Garnier
  3. 69367 Lyon

Pour tout renseignement, contactez :

  1. Thibault Andrieu: responsable plateau
  2. Tel : 04 37 28 23 32
  3. Mail : cytometrie.sfr-gerland@inserm.fr

 

Formation

Les personnels de la plateforme réalisent des formations sur les différents équipements (analogiques ou digitaux) ainsi que sur les logiciels d’analyse. Les formations proposées ci-dessous se font sur réservation :

  • Formation DIVA (logiciel & système Becton Dickinson- Théorique & Pratique)- 1jour  (supports formation DIVA n°1, n°2)
  • Formation ACCURI (logiciel & système Becton Dickinson- Théorique & Pratique)- 1jour (support formation ACCURI)
  • Formation MacsQuant (logiciel & système Miltenyi- Théorique & Pratique)- 1jour (supports formation MACSQUANT)
  • Formation FlowJo (logiciel TreeStar d'analyse des données de cytométrie) - 2 jours
  • Introduction à Cytobank (Logiciel Cytobank)    vidéo  : "Gating in Cytobank"       vidéo :  "Introduction to Visne"
  • Formation ImageStreamX (Logiciel et système AMNIS - Théorique & Pratique) - 2 jours

 

Tarifs

Tarifs accessibles en intranet (équipes contributrices et équipes académiques) ou sur demande spécifique.

Documentation

  1. Règlement intérieur du plateau technique
  2. Manuel Qualité du plateau technique
  3. Fluorescent Protein Analysis with the Accuri C6 Flow Cytometer System
  4. Display of CFlow- Generated FCS 3.0 Files using FlowJo MAC
  5. A Guide to Absolute Counting on the Accuri C6 Flow Cytometer

 

Liens

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