AniRA – AGC
CERTIFICATION
AniRA-Analyse génétique et cellulaire est intégré dans la plateforme régionale AniRA labélisée IBiSA, membre de l’Infrastructure de Recherche nationale Celphedia.
Le service Génotypage du plateau AniRA-AGC est certifié ISO 9001 : 2015
PRÉSENTATION
Le plateau AniRA-AGC (Analyse Génétique et Cellulaire) est divisé en 3 services :
- le service AniRA Analyse Génétique,
- le service AniRA Génotypage,
- le service AniRA CRB CelluloNet
1- Le service AniRA Analyse Génétique a pour mission d'accompagner les scientifiques dans le développement de projets utilisant les techniques de PCR Quantitative et de PCR Digitale.
La PCR en temps réel s'est imposée comme un outil incontournable pour mesurer des acides nucléiques avec rapidité, sensibilité et une excellente reproductibilité. Elle s'applique aussi bien à l'analyse d'expression génique ou de miRNA qu'au génotypage de SNP, à l'étude du nombre de copies (CNV), à la détection et quantification de microorganismes, ou encore à la caractérisation de mutations connues ou inconnues via des analyses de fusion haute résolution (HRM).
La PCR digitale, de son côté, simplifie considérablement la quantification par rapport à la qPCR : mise en oeuvre plus rapide, automatisation aisée, exigences moindres sur la qualité des amorces, précision accrue et meilleure sensibilité pour la détection d'évènements rares. Le multiplexage y gagne aussi en simplicité, les phénomènes de compétition ayant nettement moins d'impact.
PCR digitale QIAcuity ONE 5 Plex (Qiagen) disponible sur AniRA-AGC.
Le système QIAcuity pour PCR digitale rend la quantification absolue plus accessible que jamais. Entièrement autonome, il intègre dans un même instrument le partitionnement, le thermocyclage et l'imagerie, ce qui réduit drastiquement les manipulations. Les protocoles de qPCR classiques se transposent facilement sur cette plateforme, permettant une configuration rapide des dosages et une obtention des résultats en environ deux heures.
Localisation : bâtiment Franklin, 2ème étage, pièce 12.010.
Vous pouvez nous contacter pour + d'informations : agc.us8@inserm.fr
2- Le service AniRA Génotypage (certifié ISO 9001 : 2015)
Le service Génotypage en lien avec le Plateau de Biologie Expérimentale de la Souris (AniRA-PBES) assure le génotypage par PCR des souris transgéniques. Très largement utilisé par les membres de l’UMS 3444-US8, ce service gère un grand nombre d’analyses représentant plus 24 000 PCR par an.
3- Le service AniRA CelluloNet est un Centre de Ressources Biologiques (CRB) de lignées cellulaires qui propose une sauvegarde et une mise à disposition de lignées cellulaires. La collection compte actuellement plus de 550 lignées cellulaires, parfois uniques, constituant des modèles et des outils d’étude précieux que les chercheurs utilisent et valorisent.
Le comité scientifique du plateau AGC :
La mission du conseil scientifique est, en étroite concertation avec le responsable du plateau, de faire évoluer la technologie, de faire remonter les besoins des utilisateurs de leur unité, d'évaluer les besoins en moyens humains et techniques et de répondre aux besoins en formation des personnels. Le comité scientifique du plateau AniRA-AGC est composé des membres suivants :
- Denis Gerlier - CIRI
- Yann-Gael Gangloff - INMG
- Suzy Markossian - IGFL
- Antoine Marçais - CIRI
- Lionel Ballut - IBCP, pour la direction UAR3444
Citation de la SFR Biosciences sur les publications
ACTIVITÉS
1- Le plateau AniRA-Analyse génétique offre plusieurs services :
La plateforme gère et met à disposition une instrumentation scientifique de qualité, adaptée aux exigences de cette technologie.
Ces instruments forment un tout cohérent afin de permettre :
- La quantification et le contrôle des acides nucléiques (Nanodrop, Dropsens, Bioanalyseur)
- La préparation robotisée des plaques 96 puits QPCR (robots Tecan Qiagen) et les circuits QPCR
- Le dessin des amorces et l’analyse des résultats par des logiciels adaptés
- Quantification des acides nucléiques par QPCR ou dPCR.
Formations Conseils/expertise :
- Le plateau propose plusieurs formations pour en prendre la technologie de quantification par PCR en temps réel ou de PCR digitale.
- Le plateau apporte son aide pour la mise en place de projets, l’interprétation des résultats ou l’adaptation d’une technologie à un contexte particulier.
Veille et développements technologiques :
- La QPCR est une technologie en constante évolution : la plateforme assure une veille technologique et propose régulièrement des séminaires présentant les innovations les plus marquantes.
2- Prestations du service Génotypage :
- Réalisation des génotypages PCR pour le suivi des lignées génétiquement modifiées.
- Transfert de technologie : adaptation d'un protocole pour le génotypage d'une nouvelle lignée.
- Analyse des ADN et ARN par électrophorèse capillaire sur QIAxcel Connect Qiagen.
La plateforme est désormais équipée d'un QIAxcel Connect. Cet instrument est un système automatisé permettant la migration ainsi que le contrôle qualitatif et quantitatif des acides nucléiques par électrophorèse capillaire. Le QIAxcel améliore la précision des analyses : sa cartouche Haute Résolution peut séparer des fragments d'ADN de moins de 500pb présentant seulement 3pb de différence de tailles.
3- Prestations du service CRB CelluloNet :
- Réception de nouvelles lignées cellulaires :
Le CRB CelluloNet a vocation à recueillir en priorité toutes les nouvelles lignées cellulaires développées par les équipes contributrices de la SFR BioSciences afin d’en assurer la traçabilité et la conservation.
- Mise à disposition de lignées cellulaire :
Sur demande à l'adresse mail : agc.us8@inserm.fr
Les lignées en collection sont disponibles pour les laboratoires académiques ou pour des laboratoires de recherche à but lucratif, sous réserver du respect du contrat de dépôt dont relève chaque lignée.
Les lignées cellulaires distribuées ont été contrôlées afin de répondre aux questions grandissantes des journaux scientifiques : vérification de la bonne croissance des cellules à la décongélation et absence de contamination par des mycoplasmes.
Charte du fonctionnement du service d'Analyse Génétique
Charte de fonctionnement du service de Génotypage
CONTACT/LOCALISATION
Comment accéder aux plateaux - entrée de sites (en intranet)
Pour tout renseignement, contactez : agc.us8@inserm.fr
TARIFS
LIENS
- ECACC (European Collection of Cell Cultures)
- ICLAC (International Cell Line Authentification Committee)
- Un guide des risques biologiques (CNRS)